🧬 分子生物学 Interactive Lab

FY2026 · 慶應義塾大学薬学部 · 高橋大輔

LEC 03 · 2026-04-30

染色体とゲノム

3 つのミニツール + 12 問の復習クイズで、染色体構造・ゲノム構成・遺伝子アーキテクチャを体で覚えよう

📄 講義スライドPDF 📄 講義スライドPDF (再度試験) 📓 NotebookLM で質問・音声復習

※ 「講義スライドPDF」と「講義スライドPDF (再度試験)」は全く同一のものです。本講義 (140260) の方は左、再度試験 (144965) 受験者は右をお選びください。

🧬 Chromatin Compaction Calculator

DNA は段階的に折り畳まれて染色体を形成する。各段階をクリックすると、直径・圧縮率・関与するタンパク質・ゲノムサイズでの実際の長さが表示される。

Mbp

圧縮の階層図

💡 圧縮は単なる収納ではない: ユークロマチン (弛緩) とヘテロクロマチン (凝縮) の使い分けが遺伝子発現調節の根幹。 ヒストンのアセチル化 (HAT) → ユークロマチン化 → 転写活性化、脱アセチル化 (HDAC) → ヘテロクロマチン化 → 転写抑制。 HDAC 阻害薬 (ボリノスタット等) はこの原理を利用した抗がん剤。

🔬 Genome Composition Explorer

ヒトゲノム 32 億塩基対の中身を覗いてみよう。タンパク質をコードするエキソンは全体のわずか 1.5%
各セグメントをクリックすると詳細が展開される。

3.2 Gbp
ヒトゲノム

🌍 生物間比較と C-value パラドックス

🧫 出芽酵母

~70%
コーディング領域
12 Mbp / ~6,000 遺伝子

🐡 トラフグ

~400 Mbp
最も圧縮された脊椎動物ゲノム
反復配列が少ない

🧑 ヒト

~3,200 Mbp
~20,442 遺伝子
→ 78,120 タンパク質 (AS)

🐟 ハイギョ

~130,000 Mbp
最大級の脊椎動物ゲノム
ヒトの ~40 倍
💡 C-value パラドックス: ゲノムサイズ (C-value) は生物の複雑さと相関しない。 ハイギョのゲノムはヒトの 40 倍だが、遺伝子数はほぼ同じ。 差の大部分は反復配列 (トランスポゾン) の蓄積量の違いで説明される。

📊 重要な数字

20,442
タンパク質コード遺伝子
78,120
タンパク質 (選択的スプライシング)
~1.5%
エキソン (コーディング)
~45%
反復配列
46 本
染色体 (2n)
16,569 bp
ミトコンドリアゲノム

🧪 Gene Architecture Visualizer

真核生物の遺伝子は「エキソンの島がイントロンの海に浮かぶ」構造。
トグルボタンで各要素の表示/非表示を切り替えて、遺伝子の全体像を把握しよう。

典型的な真核生物遺伝子の構造

🏋️ 極端な例: ジストロフィン遺伝子 (DMD)

2.4 Mbp
遺伝子全長
79
エキソン数
99.4%
イントロン割合
14 kb
mRNA
427 kDa
タンパク質

ジストロフィンはヒト最大の遺伝子。2.4 Mbp のうちコーディング領域はわずか 0.6%。 転写に 約 16 時間 かかる。デュシェンヌ型筋ジストロフィー (DMD) はこの遺伝子の変異による。

🔄 選択的スプライシング: カルシトニン/CGRP 遺伝子

同じ遺伝子から組織特異的に異なる mRNA が産生される。

🦴 甲状腺 C 細胞

エキソン 1-2-3-4 を使用

E1 E2 E3 E4カルシトニン (32 aa)

血中 Ca²⁺ 濃度を下げるホルモン

🧠 神経細胞

エキソン 1-2-3-5-6 を使用 (エキソン 4 をスキップ)

E1 E2 E3 E5 E6CGRP (37 aa)

血管拡張性の神経ペプチド

💊 スプライシングを標的とした SMA 治療薬

脊髄性筋萎縮症 (SMA) は SMN1 遺伝子の欠損/変異で発症。パラログの SMN2 はエキソン 7 がスキップされ、不安定な短縮型タンパク質しか作れない。

💉 ヌシネルセン (スピンラーザ)

アンチセンスオリゴ (ASO)。SMN2 イントロン 7 の ISS-N1 に結合 → エキソン 7 インクルージョン促進 → 機能的 SMN 産生増加。髄腔内投与。

💊 リスジプラム (エブリスディ)

低分子スプライシング修飾薬。SMN2 のエキソン 7 のインクルージョンを促進。経口投与可能。

🧬 ゾルゲンスマ (オナセムノゲン)

AAV9 ベクターによる遺伝子治療。正常 SMN1 遺伝子を導入。1 回の静脈注射。

💡 エンハンサーの驚異: Sonic Hedgehog (SHH) 遺伝子の ZRS エンハンサーは、遺伝子から約 100 万塩基対 も離れた位置にあるが、DNA ループを介してプロモーターと接触し転写を活性化する。 エンハンサーは位置にも方向にも依存しない。

✅ 復習クイズ (12 問)

各問題の選択肢をクリックすると、その場で正解・解説が表示されます。
📘 問1-9: 基本問題 (染色体構造・ゲノム・遺伝子)
🏆 問10-12: 薬剤師国試改変 (発展・チャレンジ)

0 / 12 問回答済み
0 / 0
正答数 / 回答済

結果

0 / 12

💡 合格基準: 12問中10問以上正解で修了証を発行できます。不合格の場合はリセットして再挑戦してください(選択肢の順番が毎回変わります)。